1.選用的品種不適合
春季栽培香菇，早春制袋，秋、冬、春季出菇，應選擇中溫或低溫型，遲熟性品種，如939、渭香一號等。反季節栽培香菇，晚冬或早春制袋，晚春、夏、秋季出菇，宜選用中溫或高溫型，早熟性品種，如申香10號、申香6號、931、武香1號等。
若反季節栽培選用的是遲熟性品種，接種后須經3-4個月，菌絲才能達到生理成熟，若菌筒完好，可安全越夏，當年晚春和夏季不會出菇，要到秋冬和翌年春季才能出菇。同樣若春季栽培選用的是中高溫型、早熟性品種，接種后60-70天發菌，到出菇時，氣溫升高，應按照反季節栽培技術進行出菇管理，深冬及早春季節菌棒養分幾乎耗盡，產量銳減，無生產意義。
解決措施：應按照當地氣候條件和栽培季節進行選用適宜的品種和相應的栽培技術。
2.袋料里的養分不足
1.木屑選擇不合格：選用的果樹枝條等闊葉林木屑腐朽變質，致使供應香菇正常生長發育的有效營養不足甚至枯竭。選用的松、杉、樟、柏等針葉樹木屑未經處理直接使用，所含烯萜類物質能抑制甚至殺死香菇菌絲，造成菌絲營養不足，出菇受挫。
解決措施：選擇果樹、柞樹、樺木等薔薇科、殼斗科、樺木科的闊葉樹木屑較為理想，這類樹的木屑新鮮，干燥、無蟲害、無霉變。
2.袋料香菇的管理不合理：主要表現在制袋養菌、越夏和間歇養菌三個時間段。
解決措施：通過刺孔、加溫，疏堆，通風、遮陽等措施控制養菌，越夏的菌棒環境溫度為18℃-25℃。一茬菇出菇結束后，間歇養菌時間一般在7-15天，甚至更長，以使菌絲復壯，積累更多營養，下茬菇刺激出菇時間以上茬菇菇腳菌絲轉色最佳。
3.轉色管理不到位
有的菌棒因受光較強，空氣過于干燥或翻動次數過多等的影響，往往轉色過深，形成較厚的甲狀菌皮，導致出菇困難。
解決措施：轉色期間，菇棚溫度保持18-22℃，相對濕度55-75%，且維持散射光照。菌皮過厚的菌棒出菇時應通過菌棒浸水后蓋膜提溫方式軟化菌皮，再刺激出菇。
4.菌絲生長不當
菌絲接種到培養基上后，當發育到生理成熟時才能形成子實體。菌齡的長短受種性制約和環境條件影響，且溫度是影響菌絲生理成熟的關鍵。
中、低溫型品種，菌絲生長的適宜溫度為20℃-25℃，若菌絲長期處在20℃以下，尤其在10℃以下，雖然菌絲培養很長時間，但所需的積溫不夠，菌絲發育不成熟，也就不會出菇。
解決措施：將菌袋置于20℃-25℃條件下繼續培養，或把菌筒堆積起來，覆蓋薄膜提高堆溫，促使菌絲發育。
5.菇棚的溫度調節不當
冬季或者早春菇棚溫度低于8℃就會造成不出菇，這是香菇的生理特性決定的。
解決措施：通過煙道、火爐、暖氣、菇棚曬膜等方式提溫，使菇棚溫度達到8-25℃。
6.菌種質量差
菌種的好壞直接決定香菇品質的好壞，是最重要、最基礎的環節。
解決措施：生產菌種要做好出菇試驗示范，嚴格控制傳代次數，一般要控制在3次以內。菌種場要有生產菌種的基本設施及保存菌種的條件。栽培者購買菌種時，要在技術部門指導下，到信譽良好、技術力量雄厚的科研單位購買，問清品種名稱，特性，并挑選生長整齊健壯的適齡菌種，不用退化菌種和老化菌種。
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