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盡管在我國的藥品生產GMP驗證中早已推薦了臭氧滅菌方法，但臭氧在食用菌生產和黑木耳深加工的應用中是在近兩年才得到一個蓬發展的機會。使用成功的主要有以下幾個方面：
1、食用菌培養室與制菌工具的消毒滅菌
在食用菌廠，臭氧氣體用于食用菌培養室，接菌室食用菌培養室，接菌室與制菌工具與制菌工具消毒是非常方便，有效的傳統的消毒方法是用甲醛，硫磺等化學試劑熏蒸，眾所周知，甲醛，硫磺熏蒸的弊病較多，國外近期研究證明，在控制空氣微生物方面，臭氧是甲醛和其它化學熏劑的替代物。通過化學霧化，紫外線與臭氧作消毒劑的對照試驗，結論是臭氧既有效又無殘留，臭氧“大大抑制” 食用菌培養室，接菌室與制菌工具中各種細菌群體的生長。
其方法是：
（1）將臭氧發生器直接放在食用菌培養室，接菌室入門口上方或放在離地面2m-2.5m的地方加以固定，對潔凈區進行消毒滅菌；
（2）大的食用菌廠可以將臭氧發生器放在食用菌培養室，接菌室的外面，通過管道將臭氧打入各輸入口中，然后被送入各潔凈區，或采用臺式自帶風機臭氧發生器，多點設計將臭氧散布在潔凈區內，統稱為外置式臭氧發生器，外置式臭氧發生器安裝檢修方便；
（3）采用臭氧發生器連接導氣管和曝氣系統，在食用菌培養室，接菌室，黑木耳深加工廠頂部布設曝氣管網，將臭氧送入潔凈區，特別是在食用菌生產前把各菌房用臭氧提前殺菌消毒。
幾種方法消毒效果都是一樣的。從使用臭氧進行滅菌的食用菌廠的檢測報告可看到，菌檢全部合格，完全替代了令人頭痛的甲醛，硫磺熏蒸大消毒同時，能耗減少，人身健康，取得了滿意效果。
現在市場上臭氧產品五花八門，質量不一，主要是有家用小型，食品廠型，沒有專用于食用菌木耳和蘑菇的專用臭氧設備。公司專門為此設計的TLCF-G-3-A系列產品，能迅速將臭氧傳送到空間的各個地方，電腦定時控制，無死角，可達到標準潔凈度。

二、臭氧設備設計選型說明：

1、設計造型依據 

1、貴公司提供的技術要求相關數據； 

2、國家醫藥管理局《GMP驗證指南》； 

3、衛生部《消毒技術規范》2010版； 

4、《食品生產企業HACCP體系咨詢與審核》； 

5、《HACCP實用指南》； 

6、《食品生產企業HACCP體系實施指南》。 

2、臭氧滅菌方選型案

臭氧設備選型時根據 HVAC 系統所控制的潔凈區的（空間）體積及所要達到的潔凈度，從而確定所選機器的型號。

在制藥或生物工程行業，根據用戶的實際使用效果和我公司的設計經驗，一般臭氧濃度(C)的取值如下：

1、臭氧潔凈室空間滅菌，取代甲醛熏蒸-----臭氧濃度取值 (C)

a)D級(十萬級)設計：C取10ppm，即20mg/m³；潔凈區中每立方臭氧含量為20mg.

b)C級(萬級)：C取15ppm，即30mg/m³；潔凈區中每立方臭氧含量為30mg.

c)B級(千級)：C取30ppm，即60mg/m³；潔凈區中每立方臭氧含量為60mg.